Opinto-opas 2008-2009 |
|||||
| Perus | Pori | KV | Jatko | Avoin | |
|
|
|
|||||||||||||||||
Laskennallinen systeemibiologia (B) |
Aineopinnot
Olli Yli-Harja, Reija Autio
- Opintokokonaisuuden tavoitteena on tarjota opiskelijalle biologisen datan, signaalien ja kuvien analyysin sekä mallinnuksen teoreettiset perustiedot ja käytännön taidot yksinkertaisten systeemibiologisten ongelmien ratkaisemiseen.
SGN-6106 Computational Systems Biology I 5 ov ( Pakollinen )
Myös SGN-1970 Signaalinkäsittelyn kandidaatintyöseminaari on pakollinen niille opiskelijoille, jotka tekevät opintokokonaisuuteen kandidaatintyön. Lisätietoja opintojaksojen (YHTTAY-1010) suorittamisesta muissa yliopistoissa löytyy osoitteesta http://www.joopas.fi.
| Opintojakso | Opintopisteet |
| SGN-1200 Signaalinkäsittelyn menetelmät | 4 op |
| SGN-2500 Johdatus hahmontunnistukseen | 4 op |
| SGN-6156 Computational Systems Biology II | 5 op |
| Yhteensä | 13 op |
Listasta täydennetään opintokokonaisuuden laajuuteen (25)
| Opintojakso | Opintopisteet |
| BIO-1350 Biotekniikan perusteet | 3 op |
| OHJ-1150 Ohjelmointi II | 5 op |
| OHJ-1400 Olio-ohjelmoinnin peruskurssi | 4 op |
| SGN-1250 Signaalinkäsittelyn sovellukset | 4 op |
| SGN-3010 Digitaalinen kuvankäsittely I | 5 op |
| Yhteensä | 21 op |
Systeemibiologia vaatii useiden eri alojen ammattilaisten saumatonta yhteistyötä. Systeemibiologian ydinalueita ovat molekyyli- ja solubiologia, biokemia, lääketiede, matematiikka, tilastotiede, signaalin- ja kuvankäsittely ja tietotekniikka. Näiden osa-alueiden osaamista vaaditaan kun pyritään mallintamaan monimutkaisia biologisia ilmiöitä järjestelmätasolla. Matemaattisten mallien tärkeys on korostunut biologisen mittausdatan määrän kasvaessa. Laskennallinen systeemibiologia pyrkii tarjoamaan opiskelijalle perusvalmiudet toimia tässä ympäristössä. Laskennallisen systeemibiologian aineopinnot antavat teoreettisen pohjan ja käytännön taidot tarvittavien työkalujen käyttöön ja ymmärtämiseen. Opintokokonaisuus myös pyrkii antamaan opiskelijalle pohjan poikkitieteelliseen kanssakäymiseen systeemibiologian alalla. Opintokokonaisuus on osa Biotekniikan koulutusohjelmaa. Opintojakso SGN-1200 on suositeltavaa suorittaa ennen SGN-3010 suorittamista. Opintojaksot SGN-1200 ja SGN-2500 voidaan suorittaa rinnakkain.