|
|
|||||||||||||||||
Opinto-opas 2010-2011
BIO-1250 Mikrobiologia I, 3 op
|
Vastuuhenkilö
Jaakko Puhakka, Marika Nissilä, Matti Karp, Nina Virolainen
Opetus
| Opetusmuoto | P1 | P2 | P3 | P4 | Kesä | Toteutuskerrat | Luentoajat ja -paikat |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Suoritusvaatimukset
Tentti
Osasuoritusten pitää liittyä samaan toteutuskertaan
Opetukseen ja oppimiseen liittyvät periaatteet ja lähtökohdat
-
Osaamistavoitteet
Opintojakson suoritettuaan opiskelija osaa selittää mikrobiologian historian ja tutkimusalueen pääpiirteet. Opiskelija tuntee bakteerimetabolian erikoispiirteet ja osaa listata mikrobien vaihtoehtoisia energiantuottotapoja. Opiskelija tunnistaa mikrobien kasvun eri vaiheet ja osaa selittää olosuhteiden vaikutusta mikrobien kasvuun. Opiskelija osaa määritellä mikrobien aerobisen kasvatuksen periaatteet ja tehdä yhteenvedon mikrobien eliminointimenetelmistä. Opiskelija osaa selittää mikrobien perimää ja sen ilmenemistä. Opiskelija tietää geenitekniikan mahdollisuuksista ja osaa suunnitella yksinkertaisen geenien siirtokokeen. Opiskelija osaa selittää mikrobien aineenvaihdunnan monimuotoisuutta. Hän tunnistaa mikrobien erilaisia kasvuympäristöjä sekä osaa vertailla mikrobien välisiä vuorovaikutuksia. Opiskelija osaa listata anaerobirespiraation ja fermentaation periaatteet. Hän myös osaa vertailla erilaisia mikroskooppisia menetelmiä ja listata erilaisia näytteenkäsittelytapoja. Opiskelija osaa selittää biokemialliset hiilen, typen ja rikin kierrot luonnossa.
Sisältö
| Sisältö | Ydinaines | Täydentävä tietämys | Erityistietämys |
| 1. | Mikrobiologian historia ja tutkimusalue, Prokarioottisolun rakenne ja toiminta | Alkusyntyteoria, Kochin postulaatit | Mikrobiologian ja biotekniikan kehittymisen aikataulut |
| 2. | Mikrobien metabolia ja ravitsemus: bakteerimetabolian erikoispiirteet ja vaihtoehtoiset energiantuottotavat | Biologiset redox-reaktiot, korkeaenergiset yhdisteet | |
| 3. | Mikrobien kasvu ja mikrobien kasvatus aerobisissa olosuhteissa | Menetelmät bakteerimäärän laskemiseksi | |
| 4. | Mikrobien määrän rajoittaminen, mikrobien eliminoiminen ja antimikrobiaalinen kemoterapia | Kemialliset ja fysikaaliset menetelmät mikrobien kasvun rajoittamiseksi, kuolemiskinetiikka | |
| 5. | Mikrobigenetiikka ja geeniteknologian perusteita | Geenitekniikan mahdollistamat sovellukset biotekniikassa | |
| 6. | Mikrobien metabolinen diversiteetti: vedyn, rikkiyhdisteiden ja raudan hapettajabakteerit Mikrobiekologia: erilaiset kasvuympäristöt, mikrobien väliset vuorovaikutukset | Bioliuotus, ammoniakin ja nitriitin hapettajat Pinnat ja biofilmit Äärimmäiset olosuhteet | |
| 7. | Anaerobirespiraatio ja fermentaatio: periaatteet, erot, assimilatorinen ja dissimilatorinen metabolia, metanogeneesi | Anaerobirespiraatio ja fermentaatio luonnossa, hyödyntäminen | |
| 8. | Mikroskopia ja näytteen käsittely: valomikroskopia, elektronimikroskopia, näytteiden värjäystekniikat | Resoluutio ja suurennus | |
| 9. | Biogeokemialliset kierrot: hiilen kierto, typen kierto, rikin kierto | Metanogeneesi, rikin ja typen rooli aineenvaihdunnassa Biogeokemiallisten kiertojen vaikutukset ympäristöön |
Opintojakson arvostelu
Opintojakson kokonaisarvosana muodostuu tentin (100 %) arvosanasta. Arvosana 1: Osaamistavoitteiden välttävä osaaminen Arvosana 2: Osaamistavoitteiden hyvä osaaminen Arvosana 3: Hallitsee opintojakson ydinaineksen ja osaa välttävästi soveltaa sitä Arvosana 4: Ydinaineksen lisäksi hallitsee opintojakson täydentävää tietämystä ja osaa soveltaa ydinainesta Arvosana 5: Osaa soveltaa hyvin opintojakson ydinainesta ja jossain määrin täydentävää tietämystä
Arvosteluasteikko:
Opintojaksolla käytetään numeerista arviointiasteikkoa (1-5)
Osasuoritukset:
Oppimateriaali
| Tyyppi | Nimi | Tekijä | ISBN | URL | Painos,saatavuus... | Tenttimateriaali | Kieli |
| Kirja | Brock Biology of Microorganisms | Madigan, M.T., Martinko, J.M. & Parker, J. | 2006 | Englanti | |||
| Kirja | Mikrobiologian perusteita | Salkinoja-Salonen, M.S. | 2002 | Suomi | |||
| Opintomoniste | Mikrobiologia | Karp, M. | Suomi | ||||
| Opintomoniste | Mikrobiologia | Puhakka, J. | Suomi |
Esitietovaatimukset
| Opintojakso | P/S | Selite |
| BIO-1200 Biokemia I | Suositeltava |
Esitietoketju (Vaatii kirjautumisen POPiin)
Vastaavuudet
| Opintojakso | Vastaa opintojaksoa | Selite |
|
|
|
Tarkempia tietoja toteutuskerroittain
| Toteutus | Kuvaus | Opetusmuodot | Toteutustapa |
| Luennot |
Lähiopetus: 35 % Etäopetus: 0 % Itseopiskelu: 65 % |