x !
Arkistoitu opetussuunnitelma 2014–2015
Selaamasi opetussuunnitelma ei ole enää voimassa. Tarkista tiedot voimassa olevasta opetussuunnitelmasta.
BIO4280 Algorithms in bioinformatics 4 op
Vastuutaho
Master's Degree Programme in Bioinformatics
Bioinformatiikka
Vastuuhenkilö
Pentti Riikonen

Avainsanat

Strategiset teemat: kansainvälistyminen

Osaamistavoitteet

The aim of this course is to provide deeper knowledge on algorithms used in bioinformatics. Students should know how most used methods and algorithms work, like pairwise and multiple alignment, BLAST, FASTA, scoring systems, PGMA clustering, PCR and DNA fingerprinting.

Sisältö

We will focus on algorithms behind the methods introduced in the course Introduction to Bioinformatics. Such algorithms are for instance local and global alignment, sequence assembly, multiple alignment methods and algorithms in phylogenetics.

Toteutustavat

Opetustapa Paikalla Verkossa
Luento-opetus
Itsenäinen työskentely

Lectures, independent work

Opetuskieli

englanti

Vaadittavat opintosuoritukset

Suoritusvaihtoehto 1
Kohderyhmät:
  • Tutkinto-ohjelman omat opiskelijat
  • Muut opiskelijat
  • Avoimen yliopisto-opetuksen opiskelijat
  • Tohtoriopiskelijat
  • Vaihto-opiskelijat
Osallistuminen opetukseen 
englanniksi
Harjoitustyö(t) 
englanniksi
Kirjallinen tentti 
englanniksi

Lectures, exercises, written exam.

Arviointi

Numerolla 1-5.

Kirjallisuus/Oppimateriaali

Literature and lecture slides

Lisätietoja

Organization responsible: Department of Information Technology, University of Turku

Kokonaisuudet johon opintojakso kuuluu

2014–2015
Opintojakso opetusohjelmassa
Opetusohjelma ei ole enää voimassa. Tarkista tiedot voimassa olevasta opetusohjelmasta.
BioMediTech