x !
Arkistoitu opetussuunnitelma 2009–2010
Selaamasi opetussuunnitelma ei ole enää voimassa. Tarkista tiedot voimassa olevasta opetussuunnitelmasta.
BIOI4230 Fylogenetiikka 4 op
Vastuutaho
Bioinformatiikka
Vastuuhenkilö
Bairong Shen
Edeltävät opinnot
Suositellaan:
Vastaavat opinnot opetussuunnitelmassa
Lääketieteellisen teknologian instituutti
Opetussuunnitelma 2008 – 2009
BIOI4230 Phylogenetics 4 op

Osaamistavoitteet

Phylogenetics is the taxonomical classification of organisms based on how closely they are related in terms of evolutionary differences. The course will familiarize students with different phylogenetics algorithms and practical software applications for biological problems.

Sisältö

I. Theories of Molecular Evolution
II. Reconstruction of Phylogenies
a) Distance methods
b) Maximize likelihood methods
c) Parsimony methods
d) Bayesian methods
III. Computer-based practical trainings

Toteutustavat

Opetustapa Paikalla Verkossa
Luento-opetus 20 t 0 t

Opetuskieli

englanti

Vaadittavat opintosuoritukset

Lectures (approx. 20h), Journal Club and Software Demo.

Arviointi

Numerolla 1-5.

Suositellut suoritusajankohdat

1. vuoden kevät

1st year, period 4.

Kirjallisuus/Oppimateriaali

The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to DNA and Protein Phylogeny. Edited by Marco Salemi.

Lisätietoja

Organization responsible: Tampere IMT

Kokonaisuudet johon opintojakso kuuluu

Lääketieteellisen teknologian instituutti
Lääketieteellisen teknologian instituutti
Bioinformatiikka (Biokemia)
2009–2010
Opintojakso opetusohjelmassa
Opetusohjelma ei ole enää voimassa. Tarkista tiedot voimassa olevasta opetusohjelmasta.
Lääketieteellisen teknologian instituutti