The aim of this course is to provide deeper knowledge on algorithms used in bioinformatics. Students should know how most used methods and algorithms work, like pairwise and multiple alignment, BLAST, FASTA, scoring systems, PGMA clustering, PCR and DNA fingerprinting.
Sisältö
We will focus on algorithms behind the methods introduced in the course Introduction to Bioinformatics. Such algorithms are for instance local and global alignment, sequence assembly, multiple alignment methods and algorithms in phylogenetics.
Toteutustavat
Opetustapa
Paikalla
Verkossa
Luento-opetus
Itsenäinen työskentely
Lectures, independent work
Opetuskieli
englanti
Vaadittavat opintosuoritukset
Suoritusvaihtoehto
1
Kohderyhmät:
Tutkinto-ohjelman omat opiskelijat
Muut opiskelijat
Avoimen yliopisto-opetuksen opiskelijat
Tohtoriopiskelijat
Vaihto-opiskelijat
Osallistuminen opetukseen
englanniksi
Harjoitustyö(t)
englanniksi
Kirjallinen tentti
englanniksi
Lectures, exercises, written exam.
Arviointi
Numerolla 1-5.
Kirjallisuus/Oppimateriaali
Literature and lecture slides
Lisätietoja
Organization responsible: Department of Information Technology, University of Turku