Emma Raitoharju

Olen työskennellyt Tampereen Yliopistolla vuodesta 2008. Niin graduni, kuin väitöskirjani olen tehnyt Kliinisen Kemian tutkimusryhmään ja syyskuussa 2021 perustin oman, Molekylaarisen Epidemiologian ryhmän. Tutkimusurani alussa tutkin genetiikan yhteyttä valtimokovettumatautiin, sekä ysksilön riskiin saada sydänkohtaus. Tästä tutkimuskohteesta siirryin traskiptomiikan kautta tutkimaan erilaisten epigeneettisten profiilien yhteyttä kardiometabolisten sairauksiin. Erityisesti olen kiinnostunut proteiinia koodaamattomista RNA:ista sekä niiden ilmentymisen säätelystä DNA-metylaation kautta. Suuremmista tutkimuskysmyksistä haluasin päästä ratkomaan DOHaD (Develomental Origins of Health and Disease) hypoteesin ja hankittujen ominaisuuksien periytyvyyttä mahdollistavia mekanismeja.

Tutkimuskysymyksiä lähestyn epidemiologisesta näkökulmasta ja työskentelen potilas- ja seuranta-aineistojen parissa. Viime vuosina LASERI (The Young Finns Study) tutkimusaineisto on mahdollistanut suuren osan tutkimuksistani. Tutkimukseni on nykyisin pääosin laskennallista, vaikka minulla onkin vahva molekyylibiologinen tausta.

Akatemiatutkijan rahoitus "Lyhyiden proteiinia koodaamattomien RNA:iden tasojen elinikäinen pysyvyys, periytyvyys ja muutosvaste suhteessa kardiometabolisiin sairauksiin" 2021-2026

Akatemian hankerahoitus " Proteiinia koodaamattomien RNA:iden elinikäinen stabiilisuus, periytyvyys ja muutosvaste veressä, seerumissa ja spermassa suhteessa kardiometabolisiin tauteihin" 2020-2022

Molekyylibiologia, epidemiologia, epigenetiikka, biostatistiikka

Suomen Akatemia, Valtion tutkimusrahoitus, Yrjö Jahnnsonin säätiö, Laboratiolääketieteen kehittämissäätiö

1. Methylation status of nc886 epiallele reflects periconceptional conditions and is associated with glucose metabolism through nc886 RNAs. Marttila S, Viiri LE, Mishra PP, Kühnel B, Matias-Garcia PR, Lyytikäinen LP, Ceder T, Mononen N, Rathmann W, Winkelmann J, Peters A, Kähönen M, Hutri-Kähönen N, Juonala M, Aalto-Setälä K, Raitakari O, Lehtimäki T, Waldenberger M, Raitoharju E. Clin Epigenetics. 2021 Jul 22;13(1):143. doi: 10.1186/s13148-021-01132-3. IF=6.551

2. Human Prostate Tissue MicroRNAs and Their Predicted Target Pathways Linked to Prostate Cancer Risk Factors. Enwald M, Lehtimäki T, Mishra PP, Mononen N, Murtola TJ, Raitoharju E. Cancers (Basel). 2021 Jul 15;13(14):3537. doi: 10.3390/cancers13143537. IF=6.639

3. Adulthood blood levels of hsa-miR-29b-3p associate with preterm birth and adult metabolic and cognitive health. Marttila S, Rovio S, Mishra PP, Seppälä I, Lyytikäinen LP, Juonala M, Waldenberger M, Oksala N, Ala-Korpela M, Harville E, Hutri-Kähönen N, Kähönen M, Raitakari O, Lehtimäki T, Raitoharju E. Sci Rep. 2021 Apr 28;11(1):9203. doi: 10.1038/s41598-021-88465-4. IF= 4.379

4. Whole blood microRNA levels associate with glycemic status and correlate with target mRNAs in pathways important to type 2 diabetes. Mononen N, Lyytikäinen LP, Seppälä I, Mishra PP, Juonala M, Waldenberger M, Klopp N, Illig T, Leiviskä J, Loo BM, Laaksonen R, Oksala N, Kähönen M, Hutri-Kähönen N, Raitakari O, Lehtimäki T, Raitoharju E. Sci Rep. 2019 Jun 20;9(1):8887. doi: 10.1038/s41598-019-43793-4. IF = 4.259 

5. Blood hsa-miR-122-5p and hsa-miR-885-5p levels associate with fatty liver and related lipoprotein metabolism - The Young Finns Study. Raitoharju E, Seppälä I, Lyytikäinen L-P, Viikari J, Ala-Korpela M, Soininen P , Kangas AJ, Waldenberger M, Klopp N, Illig T, Leiviskä J, Loo B-M, Oksala N, Kähönen M, Hutri-Kähönen N, Laaksonen R, Raitakari O, Lehtimäki T. Sci Rep. 2017 Jan 27;7:41483. doi: 10.1038/srep41483. IF = 4.259 

6. Blood microRNA profile associates with the levels of serum lipids and metabolites associated with glucose metabolism and insulin resistance and pinpoints pathways underlying metabolic syndrome: The cardiovascular risk in Young Finns Study. Raitoharju E, Seppälä I, Oksala N, Lyytikäinen LP, Raitakari O, Viikari J, Ala-Korpela M, Soininen P, Kangas AJ, Waldenberger M, Klopp N, Illig T, Leiviskä J, Loo BM, Hutri-Kähönen N, Kähönen M, Laaksonen R, Lehtimäki T. Mol Cell Endocrinol. 2014 Apr 28;391(1-2):41-49 IF = 3.754 

7. MicroRNAs in the Atheroclerotic Plaque. Raitoharju E, Oksala N, Lehtimäki T. Clin Chem. 2013 May 31. doi: 10.1373/clinchem.2013.204917. IF = 7.292

8. MicroRNA-616 and atherosclerosis--a commentary on the paper by Liu et al. Raitoharju E. Atherosclerosis. 2013 May;228(1):42-3. IF =4.239

9. A comparison of the accuracy of Illumina HumanHT-12 v3 Expression BeadChip and TaqMan qRT-PCR gene expression results in patient samples from the Tampere Vascular Study. Raitoharju E, Seppälä I, Lyytikäinen LP, Levula M, Oksala N, Klopp N, Illig T, Laaksonen R, Kähönen M, Lehtimäki T. Atherosclerosis. 2013 Jan;226(1):149-52. IF = 4.239 

10. miR-21, miR-210, miR-34a, and miR-146a/b are up-regulated in human atherosclerotic plaques in the Tampere Vascular Study. Raitoharju E, Lyytikäinen LP, Levula M, Oksala N, Mennander A, Tarkka M, Klopp N, Illig T, Kähönen M, Karhunen PJ, Laaksonen R, Lehtimäki T. Atherosclerosis. 2011 Nov;219(1):211-7. IF = 4.239