Opintojakso, lukuvuosi 2023–2024
BBT.BI.203
High-throughput Sequencing Data Analysis, 5 op
Tampereen yliopisto
- Kuvaus
- Suoritustavat
Opetusperiodit
Aktiivinen periodissa 3 (1.1.2024–3.3.2024)
Aktiivinen periodissa 4 (4.3.2024–31.5.2024)
Koodi
BBT.BI.203Opetuskieli
englantiLukuvuodet
2021–2022, 2022–2023, 2023–2024Opintojakson taso
Syventävät opinnotArvosteluasteikko
Yleinen asteikko, 0-5Vastuuhenkilö
Vastuuopettaja:
Juha KesseliVastuuorganisaatio
Lääketieteen ja terveysteknologian tiedekunta 100 %
Järjestävä organisaatio
MET yhteinen koulutus 100 %
Contents:
Characteristics of sequencing data
Quality control
High-throughput count data modeling
MDS, tSNE, UMAP
Data analysis pipeline design
Common state-of-the-art algorithms for data analysis, for a variety of data types
Basic approaches for data integration
Introduction to systems biology
Network modeling
Design of high-throughput experiments
Osaamistavoitteet
Pakolliset esitiedot
Oppimateriaalit
Vastaavat opintojaksot
Kokonaisuudet, joihin opintojakso kuuluu
Suoritustapa 1
Osallistuminen opetukseen
10.01.2024 – 06.05.2024
Aktiivinen periodissa 3 (1.1.2024–3.3.2024)
Aktiivinen periodissa 4 (4.3.2024–31.5.2024)