Opinto-opas 2009-2010 |
|||||
| Perus | Pori | KV | Jatko | Avoin | |
|
|
|
|||||||||||||||||
Laskennallinen systeemibiologia (B), 30 op |
Syventävät opinnot
Reija Autio, Olli Yli-Harja
- Opintokokonaisuuden tavoitteena on tarjota opiskelijalle biologisen datan, signaalien ja kuvien analyysin sekä mallinnuksen teoreettiset perustiedot ja käytännön taidot yksinkertaisten systeemibiologisten ongelmien ratkaisemiseen.
| Tutkinto |
| Biotekniikan koulutusohjelma - Diplomi-insinöörin tutkinto |
| Opintokokonaisuus | Opintopisteet | P/S |
| Laskennallinen systeemibiologia (B) | 25 op | Pakollinen |
Signaalinkäsittelyn diplomityöseminaari SGN-1980 ja seminaariesitys SGN-1990 ovat pakolliset niille, jotka tekevät diplomityönsä tähän syventävään opintokokonaisuuteen.
| Opintojakso | Opintopisteet | Vuosikurssi |
| MAT-41281 Tilastolliset monimuuttujamenetelmät | 6 op | V |
| SGN-1650 Signaalinkäsittelyn työkurssi | 5 op | IV |
| SGN-1980 Signaalinkäsittelyn diplomityöseminaari | 1 op | |
| SGN-1990 Signaalinkäsittelyn diplomityöseminaariesitys | 0 op | |
| SGN-2556 Pattern Recognition | 5 op | IV |
| YHTTAY-1010 Solun biologia | 7 op | IV |
| Yhteensä | 24 op |
Vaihtoehtoisista opintojaksoista on valittava vähintään viiden pisteen edestä opintojaksoja.
Valittava vähintään 5 pisteen edestä opintojaksoja
| Opintojakso | Opintopisteet | Vuosikurssi |
| SGN-6166 Introduction to R programming | 3 op | IV |
| SGN-6176 Microarray Data Analysis | 5 op | IV |
| SGN-6186 Mathematical Modeling of Cellular Systems | 5 op | IV |
| SGN-6236 Modeling Techniques for Stochastic Gene Regulatory Networks | 3 op | IV |
| Yhteensä | 16 op |
Lisäksi Tampereen yliopiston tarjoamaa kurssia BIKE2080 (YHTTAY-2080) Bioinformatiikka voidaan käyttää täydentävänä opintojaksona.
Listasta täydennetään opintokokonaisuuden laajuuteen (30)
Systeemibiologia vaatii useiden eri alojen ammattilaisten saumatonta yhteistyötä. Systeemibiologian ydinalueita ovat molekyyli- ja solubiologia, biokemia, lääketiede, matematiikka, tilastotiede, signaalin- ja kuvankäsittely ja tietotekniikka. Näiden osa-alueiden osaamista vaaditaan kun pyritään mallintamaan monimutkaisia biologisia ilmiöitä järjestelmätasolla. Matemaattisten mallien tärkeys on korostunut biologisen mittausdatan määrän kasvaessa. Laskennallinen systeemibiologia pyrkii tarjoamaan työkalut tähän haastavaan ympäristöön. Laskennallisen systeemibiologian syventävät opinnot antavat teoreettisen pohjan ja käytännön taidot tarvittavien työkalujen suunnitteluun ja toteuttamiseen sekä systeemibiologisten ongelmien ratkaisemiseen. Opintokonaisuus antaa opiskelijalle valmiudet poikkitieteelliseen kanssakäymiseen systeemibiologian alalla. Opintokokonaisuus on osa Biotekniikan koulutusohjelmaa.